Fotograf Gallery vznikla pod názvem Fotograf studio na sklonku roku 2009 jako v pořadí druhá platforma občanského sdružení Fotograf07. Umožnila přímo a soustavně stimulovat činnost na poli umělecké fotografie a reflektovat její kontexty a mediální přesahy v současném výtvarném umění. V době vzniku byla zamýšlena jako prostor dramaturgicky spjatý s obsahem aktuálních čísel časopisu. Brzy ovšem získala autonomii jako systematicky vedený výstavní prostor v čele s kurátorem.
Galerie se zaměřuje na roli fotografie v post-mediální situaci současného umění, pro kterou je nosnou zejména širší oblast fotografického myšlení, které se nutně nemusí zhmotňovat v podobě fotografického artefaktu, ale jako způsob pohlížení a uchopování skutečnosti, případně jako základ či prostředek konceptuálních a kontextuálních operací, při níž je s fotografií nakládáno jako se specifickým nositelem vizuálních informací. V jejím programu převažují samostatné výstavy českých autorů mladší a střední generace. Každoročně zahrnuje alespoň jednu výstavu autora starší generace, případně ho doplňují kurátorské tematické výstavy.
V letech 2010 a 2012 byla kurátorkou galerie Edith Jeřábková. V polovině roku 2012 předala svoji pozici Jiřímu Ptáčkovi. Kurátor galerie je zodpovědný za koncepci programu, realizaci většiny výstav a výběr externích kurátorů. V roce 2017 se galerie přesunula ze svého dlouhodobého působiště ve Školské 28 na novou adresu Jungmannova 7, Praha 1.
V současné době galerie sestává ze dvou sálů o celkové výměře výstavní plochy 132 m2. Prostory jsou určeny také k pořádání přednášek, workshopů a dalších událostí. Provoz Fotograf Gallery podporují Ministerstvo kultury ČR a Magistrát hlavního města Prahy. Doplňkovým zdrojem financování galerie a časopisu jsou sbírková portfolia pro PPF Art, koncipovaná v návaznosti na aktuální témata jednotlivých čísel časopisu a založená na darech fotografických souborů od oslovených autorů.